DEEPPROT

Le projet ANR DeepProt vise à améliorer la caractérisation des protéines grâce au décryptage des modifications chimiques qu’elles portent, qu'il s'agisse de modifications post-traductionnelles qui modulent le fonctionnement cellulaire ou de modifications induites par des procédés alimentaires.

En s’appuyant sur une approche ‘big data’ de recherche de motifs dans de très grandes collections de spectres obtenus par spectrométrie de masse, le logiciel SpecOMS développé récemment dans le cadre d’une thèse par deux des partenaires du projet, a levé un verrou méthodologique pour l’identification de protéines modifiées. En s’appuyant sur ce développement, DeepProt souhaite maintenant relever le défi d’un meilleur taux d’interprétation des spectres.

En plus de l’élaboration de nouveaux algorithmes, DeepProt traitera les jeux de spectres issus de deux questions scientifiques majeures : l'étude des modifications protéiques induites par les procédés alimentaires (étude en relation avec l’allergénicité des aliments) et la métaprotéomique du microbiote intestinal (pour de nouvelles perspectives thérapeutiques).

Durée du projet : 4 ans (2018-2022)

Coordination : Hélène Rogniaux (Unité BIA - plateforme BIBS)

Partenaires académiques :
- INRA – BIA
- Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N - équipe Combi)
- Plateforme d'Analyse Protéomique de Paris Sud-Ouest (PAPPSO - Le Moulon)

Budget total : 506 k€ (ANR); 1.418 M€ en coût complet

Date de modification : 11 octobre 2024 | Date de création : 25 janvier 2024 | Rédaction : VW

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